進入1990年代后,全市各級政府加大對衛生事業的投入,加快衛生設施建設,改建新建醫院,購置大批高級技術設備,從根本上緩解了看病難問題。隨著改革的深入推進,衛生體制改革也不斷深化。1993年地市合并后,在全市醫療衛生單位推行院(站、所、校長)負責制,加強綜合目標管理,開展醫院分級管理體制,在較大醫院推行兩級管理、兩級核算的技術經濟責任制,實現優化組合,規范醫學繼續教育,強化專科建設,建立全面質控系統,建立預防保健網絡,增強了醫療衛生機構的活力。1997年,市委、市政府出臺《關于加快衛生改革與發展的決定》,各地根據實際,相繼制定了區域衛生規劃,進行了職工醫療保障制度、農村合作醫療、城市社區衛生服務、醫療機構內部運行機制等改革,糾正醫療購銷中的不正之風,推行藥品、醫療器械招標采購工作,降低費用,使患者得到了實惠。全市各級醫院堅持“科教興醫”方針,增加醫療設備,提高醫療技術水平,增強疾病控制能力。醫德醫風得到根本轉變。15年間,全市衛生系統優化服務意識,組織開展職業理想、職業信念、職業紀律、職業道德教育和星級窗口創建活動,下大力糾正行業不正之風,努力提高服務質量,改善醫療環境,實施便民服務措施。全市形成一個融醫療、預防、保健、科技、教育為一體,遍布城鄉的醫療衛生服務體系。