進入1990年代后，全市各級政府加大對衛生事業的投入，加快衛生設施建設，改建新建醫院，購置大批高級技術設備，從根本上緩解了看病難問題。隨著改革的深入推進，衛生體制改革也不斷深化。1993年地市合并后，在全市醫療衛生單位推行院（站、所、校長）負責制，加強綜合目標管理，開展醫院分級管理體制，在較大醫院推行兩級管理、兩級核算的技術經濟責任制，實現優化組合，規范醫學繼續教育，強化專科建設，建立全面質控系統，建立預防保健網絡，增強了醫療衛生機構的活力。1997年，市委、市政府出臺《關于加快衛生改革與發展的決定》，各地根據實際，相繼制定了區域衛生規劃，進行了職工醫療保障制度、農村合作醫療、城市社區衛生服務、醫療機構內部運行機制等改革，糾正醫療購銷中的不正之風，推行藥品、醫療器械招標采購工作，降低費用，使患者得到了實惠。全市各級醫院堅持“科教興醫”方針，增加醫療設備，提高醫療技術水平，增強疾病控制能力。醫德醫風得到根本轉變。15年間，全市衛生系統優化服務意識，組織開展職業理想、職業信念、職業紀律、職業道德教育和星級窗口創建活動，下大力糾正行業不正之風，努力提高服務質量，改善醫療環境，實施便民服務措施。全市形成一個融醫療、預防、保健、科技、教育為一體，遍布城鄉的醫療衛生服務體系。
